Capas
Las capas te permiten organizar tu pintura. Funcionan a nivel de página: cada página del cuaderno tiene las suyas, y no se comparten entre páginas.

Límite de capas
Puedes crear un máximo de 24 capas por página.
Cuando te acerques a ese límite, notarás que la pintura va algo más lenta.
Funciones de capa
Opacidad
Podrás modificar la transparencia de la capa seleccionada.

Modos de mezcla
Los modos de mezcla cambian cómo se combina la capa que tienes activa con las que están debajo.

El control se llama Blend y ofrece 16 modos, desde los más básicos (Normal, Multiply, Screen, Overlay, Darken, Lighten) hasta los que cambian el tono, la saturación, el color o la luminosidad de lo que hay debajo. Se aplica a la capa activa, o a todas las que tengas seleccionadas a la vez.
Duplicar capa
Crea una copia de la capa seleccionada, justo encima, con todo su contenido. Muy útil para retocar una zona sin miedo a tocar la original.
Mover capa
Podrás mover la capa a lo largo del listado de capas para cambiar su posición, ya sea arrastrando o presionando los botones de subir y bajar capa.

Mostrar / Ocultar
La capa deja de verse, pero no se elimina: sigue existiendo.

Eliminar
Borra la capa y su contenido.

Bloquear
Evita que se pueda modificar o mover el contenido de la capa bloqueada.

Bloquear píxeles transparentes
Hace que solo se pueda pintar en las zonas de la capa seleccionada donde hay algo pintado, no en las zonas transparentes.

Seleccionar varias capas
Cada capa tiene una casilla a su izquierda. Marcando varias, todas las acciones de capa se aplican a la selección completa a la vez.
Pegar imagen del clipboard
Pegará la imagen que haya en el portapapeles del sistema en una nueva capa.

Aplicar imagen (Flatten)
Unirá todas las capas en una capa nueva como una imagen única.

Combinar hacia abajo
Unirá la capa seleccionada con la capa inferior.
Aplanar todo
Combinará todas las capas en una única capa. A diferencia de "Aplicar imagen", esta acción es destructiva: elimina todas las capas menos la nueva.
Borrar seleccionadas
Borrará todas las capas que tengas marcadas con su casilla de selección.